是本院重点发展的具有中医特色的科室，是集医疗、预防、保健、康复、临床教学为一体的科室，也是南阳医专“李氏针灸工作室”临床实训基地。
现有主任医师、教授 1 名，副主任医师 2 名，主治医师 2 名，医师 7 名，康复治疗师 8 名，护士 7 名。分针灸康复科病区及中医日间病房，共开放治疗床百余张，内含针灸、肌肉骨骼疼痛诊疗中心及康复中心三部分。针灸部分由豫宛祖传针灸“李氏针灸”第五代传承人李传岐、潘华等名家坐诊；肌肉骨骼疼痛诊疗中心部分引进国际最先进运动康复诊疗理念，实现精准评估，并为患者制定个体化治疗方案，提升各类肌肉骨骼疼痛疾病的诊疗
效果；康复中心开设多种康复设备，主要针对神经系统损伤，如：脑出血、脑梗塞恢复期、后遗症期的治疗和康复。将传统的中医非药物疗法与现代康复医学有机结合，形成了临床疗效确切的中风病综合防治方案。
科室在继承和发扬“李氏针灸”的基础上，重视并开展热敏灸、雷火灸、炼脐灸、督灸等各种先进灸疗技术，注重传统中医与现代医学相结合，治疗各种类型颈椎病、肩周炎、腰椎间盘突出症、膝关节骨性关节炎、网球肘、小儿桡骨半脱位等常见疼痛类疾病及面瘫、痤疮、失眠、中风后遗症、胃肠道疾病、神经性耳鸣、耳聋、带状疱疹、静脉曲张、丝状扁平疣、刺瘊、水瘊、痛风、肥胖病、痛经、月经不调、卵巢功能低下、不孕症、臂丛神
经损伤、桡神经损伤等多发疾病。